2008―2012奉化市成人麻疹临床分析与病毒基因特征研究
摘要:目的:应用分子生物学方法检测奉化市2008-2010年成人感染麻疹病毒,分析麻疹病毒基因特性,了解成人麻疹的发病原因,为麻疹监测和防治提供依据。方法:收集100例成人麻疹患者的咽拭子和血清,应用逆转录-聚合酶链反应扩增麻疹野毒株的核蛋白(N)基因碳末端的456个核苷酸并进行核苷酸序列测定,与基因库中按照病毒各基因型参考株比较并分析毒株变异情况。结果:奉化市成人麻疹临床表现典型,分离到的麻疹病毒均为H1基因型,与H1型参考株的核苷酸同源性为97.1%-98.0%,与中国疫苗株沪191的核苷酸/氨基酸差异为8.0-9.0%/9.8-14.5%。
关健词:成人麻疹 流行病学 病毒基因 资料与方法
一、 研究对象
二、 方法
2.1、病毒RNA提取
取出三个样品(麻疹病毒不同分离株,-80℃冻存,取至上海分子病毒实验ง室)和一个标准株作阳性对照。麻疹减毒活疫苗沪191(取至上海疾控中心),采用德国QIAGEN公司的Rneasy Mini Kit,按试剂盒说明书提取麻疹RNA
2.2、引物
2.3、逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)
2.4、核苷酸序列测定及分析
扩增后产物送上海Invitrฒogen公司进行序列测定,测序结果的序列拼接、处理分析使用了DNA BSTAR软件,其余参比的代表株序列均来自基因库(GenBank)。
3结果
3.1、入组病例临床资料分析
3.2、基因亲圆形关系树
将所测得的3株麻疹野病毒N基因碳末端的456bp核苷酸序列与Genebank中麻疹病毒各基因型参考株进行比对,明确本研究中分离到的3株麻疹病毒基因型均为H£型,与中国流行的基因型一致。有图3可见,3株麻疹病毒均属H1基因型中的H1a亚型,与其他参考株之间存在较大的差异。
3.3、序列分析及同源性
4讨论
参考文献ค:
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